Թուբերկուլյոզի ախտորոշման եւ թմրանյութերի դիմադրության հայտնաբերման նոր զենք. Նոր սերունդ նպատակային հաջորդողականություն (TNGS), որը զուգորդվում է տուբերկուլյոզի հիպերսենսիզմի ախտորոշման հետ
Գրականության զեկույց. CCA. Dngs- ի եւ մեքենայական ուսուցման հիման վրա ախտորոշիչ մոդել, որը հարմար է ավելի քիչ մանրէային տուբերկուլյոզով եւ տուբերկուլյոզային մենինգիտով:
Թեզի վերնագիր. TuberCulous- ի նպատակային հաջորդ սերնդի հաջորդականացում եւ մեքենայական ուսուցում. Ծխախոտ թոքային խողովակների եւ խողովակային մենինգիտի ծայրահեղ զգայուն ախտորոշիչ ռազմավարություն:
Պարբերական. «Clinica Chimica Acta»
Եթե, 6,5
Հրապարակման ամսաթիվը `2024 թվականի հունվարի
Չինական Գիտությունների ակադեմիայի եւ Պեկինի կրծքավանդակի համալսարանի հետ կապիտալ բժշկական համալսարանի, մակրո եւ միկրո-թեստի հետ համատեղ տեղադրեց տուբերկուլյոզի ախտորոշման մոդել, հիմնվելով նպատակային հաջորդականության (TNGS) տեխնոլոգիայի եւ մեքենայական ուսուցման մեթոդի նոր սերնդի վրա, որն ապահովում էր ծայրահեղ բարձր Թուբերկուլյոզի համար հսկայական զգայունություն մի քանի մանրէներ եւ տուբերկուլյոզային մենինգիտով, մատուցելով կլինիկական ախտորոշման նոր հիպերսենզիտիվության ախտորոշման մեթոդ TuberCulosis- ի երկու տեսակի եւ օգնեց ճշգրիտ ախտորոշմանը, թմրամիջոցների դիմադրության հայտնաբերմանը եւ տուբերկուլյոզի բուժմանը: Միեւնույն ժամանակ, պարզվում է, որ հիվանդի պլազմային CFDNA- ն կարող է օգտագործվել որպես համապատասխան նմուշ տիպ `կլինիկական նմուշառման համար TBM ախտորոշման մեջ:
Այս ուսումնասիրության ընթացքում երկու կլինիկական խմբաքանակ ստեղծելու համար օգտագործվել են 227 պլազմային նմուշներ եւ ուղեղային հեղուկի նմուշներ, որոնցում օգտագործվել են լաբորատոր ախտորոշիչ Cohort- ի նմուշները տուբերկուլյոզի ախտորոշման մեքենայի ուսուցման մոդելը, եւ հաստատվածը հաստատելու համար օգտագործվել են կլինիկական ախտորոշիչ Cohort նմուշներ ախտորոշիչ մոդել: Բոլոր նմուշներն առաջին անգամ ուղղված էին հատուկ նախագծված նպատակային գրավման զոնդով `MyCobacterium տուբերկուլյոզի համար: Այնուհետեւ, ելնելով TB-TNGS- ի հաջորդականացված տվյալների վրա, որոշումների ծառի մոդելը օգտագործվում է լաբորատոր ախտորոշիչ հերթի վերապատրաստման եւ վավերացման հավաքածուների վրա 5 անգամ խաչաձեւ վավերացում, եւ ստացվում են պլազմային նմուշների ախտորոշիչ շեմերը եւ ուղեղային հեղուկի նմուշները: Ձեռք բերված շեմն բերվում է կլինիկական ախտորոշման հերթի երկու փորձարկման հավաքածու `հայտնաբերման համար, եւ սովորողի ախտորոշիչ կատարումը գնահատվում է ROC կորի միջոցով: Վերջապես ստացվեց տուբերկուլյոզի ախտորոշման մոդելը:
Նկար 1 հետազոտական դիզայնի սխեմատիկ դիագրամ
Արդյունքներ. Այս ուսումնասիրության մեջ որոշված CSF DNA նմուշի (AUC = 0.974) եւ պլազմային CFDNA նմուշը (AUC = 0.908), 227 նմուշների շարքում, CSF նմուշի զգայունությունը կազմել է 97.65%, եւ Պլազմայի նմուշի զգայունությունն ու առանձնահատկությունը կազմել են 82,61% եւ 86.36%: TBM- ի հիվանդներից պլազմային CFDNA- ի եւ ուղեղային հեղուկի DNA- ի 44 զույգ նմուշների վերլուծության մեջ այս ուսումնասիրության ախտորոշիչ ռազմավարությունն ունի բարձր հետեւողականություն 90.91% (40/44) պլազմային CFDNA եւ ուղեղային հեղուկ հեղուկի վրա, իսկ զգայունությունը `95,45% (42/44): Թոքային տուբերկուլյոզ ունեցող երեխաների մոտ այս ուսումնասիրության ախտորոշիչ ռազմավարությունն ավելի զգայուն է պլազմային նմուշների նկատմամբ, քան նույն հիվանդներից ստամոքսային հյութի նմուշների xpert հայտնաբերման արդյունքները (28,57% ընդդեմ 15.38%):
Նկար 2 Բնակչության նմուշների համար տուբերկուլյոզի ախտորոշման մոդելի վերլուծություն
Նկար 3 Զուգավորված նմուշների ախտորոշիչ արդյունք
Եզրակացություն. Այս ուսումնասիրության մեջ ստեղծվել է տուբերկուլյոզի ենթադրյալ ախտորոշիչ մեթոդ, որը կարող է ախտորոշիչ գործիք տրամադրել օլիգոբլիրական տուբերկուլյոզով կլինիկական հիվանդների համար ամենաբարձր հայտնաբերման զգայունությամբ (բացասական մշակույթ): Պլազմային CFDNA- ի հիման վրա հիպերսենսիվ տուբերկուլյոզի հայտնաբերումը կարող է լինել համապատասխան նմուշի տեսակը ակտիվ տուբերկուլյոզի եւ տուբերկուլյոզի մենինգիտի ախտորոշման համար (պլազմային նմուշները ավելի հեշտ է հավաքել ուղեղի տուբերկուլյոզի մեջ կասկածվող հիվանդների համար):
Բնօրինակ հղում. HTTPS://www.scienceirect.com/sciest/article/pii/s0009898123004990? % 3DIHUB
Մակրո եւ միկրո-միկրո-թեստային տուբերկուլյոզի շարքի կարճ ներդրումը
Հաշվի առնելով տուբերկուլյոզի հիվանդների եւ տարբեր կարիքների բարդ նմուշը, մակրո եւ միկրո-թեստը ապահովում է լուրերի լուծումների ամբողջական փաթեթ `սպառնալիքների նմուշներից, որակեկային գրադարանների կառուցումից եւ տվյալների վերլուծությունից: Ապրանքները ընդգրկում են տուբերկուլյոզի հիվանդների արագ ախտորոշումը, տուբերկուլյոզի դեղերի դիմադրության հայտնաբերումը, MyCobacterium տուբերկուլյոզի եւ NTM- ի տպագրումը, բակտերիաների բացասական տուբերկուլյոզի եւ տուբերկուլյոզի ախտորոշումը եւ այլն:
Սերիական հայտնաբերման հավաքածուներ տուբերկուլյոզի եւ MyCobacteria- ի համար.
| Նյութ ոչ | Ապրանքի անվանումը | Ապրանքի փորձարկման բովանդակություն | Նմուշի տեսակը | Կիրառելի մոդել |
| HWTS-3012 | Նմուշի թողարկման գործակալ | Օգտագործված է փխրուն նմուշների հեղուկացման բուժման մեջ, ձեռք է բերել առաջին կարգի ռեկորդային համարը, Sutong Machinery Equipment 20230047: | սփռվող | |
| HWTS-NGS-P00021 | Qualcomm քանակի հայտնաբերման հավաքածու գերզգայուն տուբերկուլյոզի համար (զոնդ գրավման մեթոդ) | Ոչ ինվազիվ (հեղուկ բիոպսիա) գերզգայունության հայտնաբերում մանրեների բացասական թոքային տուբերկուլյոզի եւ ուղեղի նոդուլների համար. Տուբերկուլյոզով կամ ոչ տուբերկուլյոզով վարակված մարդկանց նմուշները վերլուծվել են բարձրակարգ հաջորդականությամբ մետագենոմիկայի կողմից, եւ հայտնաբերման մասին տեղեկությունները, թե տուբերկուլյոզը կամ ոչ տուբերկուլյոզի MyCobacterias- ը վարակվել են եւ MyCobacterium տուբերկուլյոզի տրամադրվել են: | Ծայրամասային արյուն, ալվեոլային լվացքի հեղուկ, հիդրոտորաքս եւ Ascites, Focus պունկցիայի նմուշ, ուղեղային հեղուկ: | Երկրորդ սերունդ |
| HWTS-NGS-T001 | MyCobacterium մուտքագրման եւ թմրամիջոցների դիմադրության հայտնաբերման հավաքածու (Multiplex Amplification- ի հաջորդականության մեթոդ) | MyCobacterium մուտքագրման թեստ, ներառյալ MTBC եւ 187 NTM;MyCobacterium տուբերկուլյոզի թմրամիջոցների դիմադրության հայտնաբերում ընդգրկում է թմրամիջոցների դիմադրության գեների 13 դեղամիջոց եւ 16 հիմնական մուտացիայի վայրեր: | Sputum, Alveolar Lavage հեղուկ, Hydrotorax եւ Ascites, Focus պունկցիայի նմուշ, ուղեղային հեղուկ: | Երկրորդ / երրորդ սերնդի երկակի պլատֆորմ |
Հատկություններ. HWTS-NGS-T001 MyCobacterium մուտքագրման եւ թմրանյութերի դիմադրության հայտնաբերման հավաքածու (բազմակի ուժեղացման մեթոդ)
Ապրանքի ներածություն
Ապրանքը հիմնված է առաջին եւ երկրորդ գծային դեղերի վրա, որոնք նկարագրված են ԱՀԿ բուժման ուղեցույցներում, մակրոլիդիդներ եւ ամինոգլերսիդներ, որոնք սովորաբար օգտագործվում են NTM բուժման ուղեցույցներում, եւ թմրանյութերի դիմադրության կայքերը ծածկում են թմրանյութերի դիմադրության հետ կապված բոլոր տեղերը Ովքեր MyCobacterium տուբերկուլյոզի բարդ մուտացիայի կատալոգ, ինչպես նաեւ այլ հաղորդված թմրամիջոցների դիմադրության գեներ եւ մուտացիայի կայքեր ըստ հետաքննության եւ վիճակագրության բարձր գնահատող գրականություններ տանը եւ արտերկրում:
Նույնականացումը տեղադրված է NTM- ի լարում, որոնք ամփոփված են NTM- ի ուղեցույցներում, որոնք հրապարակվել են չինական հանդեսը տուբերկուլյոզի եւ շնչառական հիվանդությունների եւ փորձագետների կոնսենսուսի կողմից: Նախագծված մուտքագրման նախադրյալները կարող են ուժեղացնել, հաջորդականությունը եւ ծանոթացնել ավելի քան 190 NTM տեսակ:
Թիրախավորված MultiSplex PCR AMPLLIFICAL տեխնոլոգիայի միջոցով Genotyping գեները եւ MyCobacterium- ի թմրամիջոցների դիմացկուն գեները ուժեղացվել են MultiSplex PCR- ի կողմից, եւ ձեռք է բերվել հայտնաբերված թիրախային գեների ամպլիկոնի համադրությունը: Ամրապնդված արտադրանքը կարող է կառուցվել երկրորդ սերնդի կամ երրորդ սերնդի բարձրորակ ընտրանքային գրադարանների, եւ երկրորդ սերնդի եւ երրորդ սերնդի հաջորդականացվող բոլոր պլատֆորմները կարող են ենթարկվել բարձրակարգ հաջորդականության, նպատակային գեների հաջորդականության տեղեկատվությունը ստանալու համար: Համեմատելով ներկառուցված տեղեկատու տվյալների բազայում պարունակվող հայտնի մուտացիաների հետ (ներառյալ, թե ով է MyCobacterium տուբերկուլյոզի բարդ մուտացիայի կատալոգը եւ դրա փոխհարաբերությունները թմրանյութերի դիմադրության հետ կապված, որոշվում են թմրանյութերի դիմադրության կամ հակաթթ տուբերկուլյոզի դեղերի հետ կապված մուտացիաները: Կլինիկական եւ միկրո-թեստի ինքնաբացարկային նմուշի բուժման միջոցով զուգակցված կլինիկական սփրեյի նմուշների ցածր միջուկային թթվային ուժեղացման խնդիրը (ավանդական մեթոդներից տասն անգամ ավելի բարձր), որպեսզի կարող է լինել թմրանյութերի դիմադրության բացահայտման հայտնաբերումը ուղղակիորեն կիրառվել է կլինիկական սփռոցի նմուշներ:
Ապրանքի հայտնաբերման միջակայք
34թմրամիջոցների դիմադրության հետ կապված գեներ18Հակա-տուբերկուլյոզային դեղեր եւ6Հայտնաբերվել են NTM դեղեր, ծածկում297թմրամիջոցների դիմադրության վայրեր; MyCobacterium տուբերկուլյոզի տասը տեսակ եւ ավելին190հայտնաբերվել են NTM տեսակի տեսակներ:
Աղյուսակ 1. 18 + 6 դեղերի մասին տեղեկատվություն + 190 + NTM
Ապրանքի առավելությունը
Ուժեղ կլինիկական հարմարվողականություն. Ծխախոտի նմուշները կարող են ուղղակիորեն հայտնաբերվել ինքնազբաղման միջոցով առանց մշակույթի:
Փորձարարական գործողությունը պարզ է. Ամրապնդման գործողության առաջին փուլը պարզ է, եւ գրադարանի շինարարությունն ավարտվում է 3 ժամվա ընթացքում, ինչը բարելավում է աշխատանքի արդյունավետությունը:
Համապարփակ մուտքագրում եւ թմրանյութերի դիմադրություն. MTB եւ NTM- ի մուտքագրման եւ թմրանյութերի դիմադրության վայրերը, որոնք կլինիկական մտահոգության առանցքային կետերն են, ճշգրիտ մուտքագրման եւ թմրանյութերի դիմադրության հայտնաբերման, անկախ վերլուծության ծրագրային ապահովման աջակցություն եւ մեկ կտտոցով վերլուծության հաշվետվություններ:
Համատեղելիություն. Ապրանքի համատեղելիություն, հարմարեցնելով հիմնական ILM եւ MGI / ONT հարթակներին:
Ապրանքի ճշգրտում
| Ապրանքի կոդ | Ապրանքի անվանումը | Հայտնաբերման պլատֆորմ | Տեխնիկական պայմաններ |
| HWTS-NGS-T001 | MyCobacterium մուտքագրման եւ թմրանյութերի դիմադրության հայտնաբերման հավաքակազմ (բազմակի ուժեղացման մեթոդ) | Ont, Illumina, Mgi, Salus Pro | 16/96RXN |
Փոստի ժամանակը, Jan-23-2024