Տուբերկուլյոզի ախտորոշման և դեղորայքային դիմադրության հայտնաբերման նոր զենք. նոր սերնդի թիրախային հաջորդականացում (tNGS)՝ զուգակցված մեքենայական ուսուցման հետ տուբերկուլյոզի գերզգայունության ախտորոշման համար
Գրականության զեկույց. CCa. tNGS-ի և մեքենայական ուսուցման վրա հիմնված ախտորոշիչ մոդել, որը հարմար է ավելի քիչ բակտերիալ տուբերկուլյոզով և տուբերկուլյոզային մենինգիտով տառապող մարդկանց համար։
Ատենախոսության վերնագիր՝ Տուբերկուլյոզի դեմ ուղղված հաջորդ սերնդի հաջորդականացում և մեքենայական ուսուցում. թոքային խողովակավոր անոթների և խողովակավոր մենինգիտի գերզգայուն ախտորոշիչ ռազմավարություն։
Պարբերական՝ 《Clinica Chimica Acta》
ԵԹԵ՝ 6.5
Հրապարակման ամսաթիվ՝ 2024 թվականի հունվար
Չինաստանի գիտությունների ակադեմիայի համալսարանի և Պեկինի մայրաքաղաքային բժշկական համալսարանի Պեկինի կրծքային հիվանդանոցի հետ համատեղ, Macro & Micro-Test-ը ստեղծել է տուբերկուլյոզի ախտորոշման մոդել՝ հիմնված թիրախային հաջորդականության (tNGS) նոր սերնդի տեխնոլոգիայի և մեքենայական ուսուցման մեթոդի վրա, որը ապահովել է տուբերկուլյոզի և տուբերկուլյոզային մենինգիտի գերբարձր հայտնաբերման զգայունություն՝ քիչ բակտերիաներով, ապահովել է գերզգայունության ախտորոշման նոր մեթոդ տուբերկուլյոզի երկու տեսակների կլինիկական ախտորոշման համար և նպաստել է տուբերկուլյոզի ճշգրիտ ախտորոշմանը, դեղորայքային դիմադրության հայտնաբերմանը և բուժմանը: Միևնույն ժամանակ, պարզվել է, որ հիվանդի պլազմայի cfDNA-ն կարող է օգտագործվել որպես համապատասխան նմուշ՝ տուբերկուլյոզի տուբերկուլյոզի ախտորոշման կլինիկական նմուշառման համար:
Այս ուսումնասիրության մեջ 227 պլազմայի և ուղեղ-ողնուղեղային հեղուկի նմուշներ օգտագործվել են երկու կլինիկական կոհորտներ ստեղծելու համար, որոնցում լաբորատոր ախտորոշիչ կոհորտային նմուշներն օգտագործվել են տուբերկուլյոզի ախտորոշման մեքենայական ուսուցման մոդելը ստեղծելու համար, իսկ կլինիկական ախտորոշիչ կոհորտային նմուշները՝ հաստատված ախտորոշիչ մոդելը ստուգելու համար: Բոլոր նմուշները նախ թիրախավորվել են Mycobacterium tuberculosis-ի համար հատուկ մշակված թիրախային որսման զոնդերի միջոցով: Այնուհետև, TB-tNGS հաջորդականության տվյալների հիման վրա, որոշումների ծառի մոդելն օգտագործվում է լաբորատոր ախտորոշիչ հերթի ուսումնական և վավերացման հավաքածուների վրա 5-անգամյա խաչաձև վավերացում կատարելու համար, և ստացվում են պլազմայի նմուշների և ուղեղ-ողնուղեղային հեղուկի նմուշների ախտորոշիչ շեմերը: Ստացված շեմը բերվում է կլինիկական ախտորոշման հերթի երկու թեստային հավաքածուների մեջ՝ հայտնաբերման համար, և սովորողի ախտորոշիչ կատարողականությունը գնահատվում է ROC կորով: Վերջապես, ստացվել է տուբերկուլյոզի ախտորոշման մոդելը:
Նկ. 1՝ հետազոտության նախագծման սխեմատիկ դիագրամ
Արդյունքներ՝ Այս ուսումնասիրության ընթացքում որոշված ուղեղ-ողնուղեղային հեղուկի ԴՆԹ նմուշի (AUC = 0.974) և պլազմայի cfDNA նմուշի (AUC = 0.908) սպեցիֆիկ շեմերի համաձայն, 227 նմուշներից ՈՂՀ նմուշի զգայունությունը կազմել է 97.01%, յուրահատկությունը՝ 95.65%, իսկ պլազմայի նմուշի զգայունությունը և յուրահատկությունը՝ 82.61% և 86.36%: TBM հիվանդներից պլազմայի cfDNA-ի և ուղեղ-ողնուղեղային հեղուկի ԴՆԹ-ի 44 զույգ նմուշների վերլուծության արդյունքում այս ուսումնասիրության ախտորոշիչ ռազմավարությունն ունի բարձր կոնսիստենցիա՝ 90.91% (40/44) պլազմայի cfDNA-ի և ուղեղ-ողնուղեղային հեղուկի ԴՆԹ-ի մեջ, իսկ զգայունությունը՝ 95.45% (42/44): Թոքային տուբերկուլյոզով երեխաների մոտ այս ուսումնասիրության ախտորոշիչ ռազմավարությունն ավելի զգայուն է պլազմայի նմուշների նկատմամբ, քան նույն հիվանդներից ստամոքսահյութի նմուշների Xpert հայտնաբերման արդյունքները (28.57% ընդդեմ 15.38%):
Նկ. 2. Տուբերկուլյոզի ախտորոշման մոդելի վերլուծության կատարողականը բնակչության նմուշների համար
