Հեյլունցզյանում կրծողների «հարուցիչների բանկի» բացումը. հիմնական հարուցիչների հայտնաբերում, այդ թվում՝ Լասսայի և հանտավիրուսների

Վերջերս կատարված մետագենոմիկ ուսումնասիրությունը բացահայտել է Հեյլունցզյան նահանգում կրծողների կողմից տարածվող վիրուսների և մանրէների զարմանալիորեն բազմազան սպեկտր, այդ թվում՝ Լասսայի վիրուսը, Ամուրի վիրուսը, Սալմոնելան և Yersinia pestis-ը։

Հետազոտության մեջ օգտագործվել էMacro & Micro-Test-ի պաթոգեն ՌՆԹ-ի հարստացման հավաքածու, հիմնված զոնդ որսման տեխնոլոգիայի վրա: Ընտրողաբար սպառելով հյուրընկալող rRNA-ն և այլ պահպանված հյուրընկալող բեկորները, մեթոդը արդյունավետորեն պահպանել է մանրէային RNA-ն, զգալիորեն բարելավելով պաթոգենի հայտնաբերման զգայունությունը: Պաթոգենի RNA-ի հարստացման այս քայլը կարևոր էր բարձր հայտնաբերման մակարդակի հասնելու համար և ապահովում էր պաթոգենի հսկողության համար ամուր տեխնիկական աջակցություն:

Կրծողներ՝ զոոնոզ հիվանդությունների հիմնական ջրամբարներ

Կրծողները կաթնասունների ամենահարուստ և լայնորեն տարածված խումբն են, որոնք ամբողջ աշխարհում ներառում են ավելի քան 2000 տեսակ և կազմում են բոլոր կաթնասունների տեսակների ավելի քան 40%-ը։

Իրենց էկոլոգիական կարևորությունից զատ, կրծողները ծառայում են որպես բազմաթիվ զոոնոտիկ հարուցիչների հիմնական ջրամբարներ և վեկտորներ։Քանի որ կրծողների բնակավայրերը հաճախ համընկնում են մարդկային միջավայրերի հետ՝ ուղիղ խայթոցների, կղանքի հետ շփման կամ 벼룩ների և տզերի միջոցով անուղղակի փոխանցման միջոցով, նրանցում պահվող հարուցիչները մշտական ​​սպառնալիք են ներկայացնում հանրային առողջության համար։

Հատկանշական է, որ ի հայտ եկող վարակիչ հիվանդությունների ավելի քան 70%-ը ծագում է վայրի բնությունից, ընդ որում՝ կրծողները ներկայացնում են վիրուսի ամենակարևոր տարածողներից մեկը։

Հեյլունցզյանի սահմանային շրջան. առաջնագիծ պաթոգենների հսկողության համար

Հեյլունցզյանը, որը Չինաստանի հյուսիս-արևելքում գտնվող սահմանային նահանգ է, ունի առատ էկոլոգիական ռեսուրսներ և սահմանակից է մի շարք երկրների հետ: Հարուստ կենսաբազմազանության և սահմանային բնակչության հաճախակի տեղաշարժի համադրությունը բարենպաստ պայմաններ է ստեղծում պաթոգենների փոխանցման համար:

2021 թվականի հունիսից հուլիս ընկած ժամանակահատվածում հետազոտողները Մուդանցզյան քաղաքի Հենգդաոհեզի քաղաքից հավաքել են 67 վայրի կրծող։ Նմուշները ներառում էին.

լ 20Ապոդեմոս թերակղզի

լ 47Մյոդես ռուֆոկանուս

Բոլոր նմուշները որսացվել են բնակելի տարածքներում և շրջակա գյուղատնտեսական հողերում, ինչը ընդգծում է մարդկային բնակավայրերի և վայրի բնության բնակավայրերի միջև սերտ կապը։

Պաթոգենի հարստացման տեխնոլոգիա. Հյուրընկալողի ֆոնային միջամտության հաղթահարում

Մետագենոմիկ հաջորդականության մեջ տիրոջ ՌՆԹ-ն սովորաբար գերիշխում է հաջորդականության ընթերցումների վրա՝ քողարկելով ցածր առատության պաթոգենների ազդանշանները։

Այս խնդիրը լուծելու համար ուսումնասիրության մեջ կիրառվել էMacro & Micro-Test-ի պաթոգենի մետագենոմիկ հայտնաբերման հավաքածու։ Օգտագործելով զոնդ որսման տեխնոլոգիա, հատուկ նախագծված զոնդերը կապվում են տիրոջ rRNA-ին և պահպանված հաջորդականություններին, ինչը հնարավորություն է տալիս սպառել դրանք և այդպիսով հարստացնել մանրէային ՌՆԹ-ն։

Այս մոտեցումը զգալիորեն բարելավեց պաթոգենի հայտնաբերման զգայունությունը՝ թույլ տալով հաջորդականության հետագա ուսումնասիրությանը վերականգնել պաթոգենի կարդացման ավելի մեծ մասնաբաժին: Հարստացման քայլը ամուր հիմք դրեց կրծողների կողմից կրվող պաթոգենի սպեկտրի ճշգրիտ բնութագրման համար:

Հարստացումից հետո ՌՆԹ նմուշները ենթարկվել են հակադարձ տրանսկրիպցիայի, գրադարանի կառուցման և բարձր արդյունավետությամբ հաջորդականության որոշման: Կենսաինֆորմատիկ վերլուծությունը ներառել է.

լ Հյուրընկալողի գենոմի ֆիլտրում

l Տաքսոնոմիկ դասակարգում՝ օգտագործելով Kraken2

լ Առատության ուղղում Բրակենի միջոցով

Այս աշխատանքային հոսքը ստեղծեց վիրուսային և մանրէային համայնքների համապարփակ պրոֆիլ։

Հետազոտության արդյունքներ. բազմաթիվ վիրուսների և մանրէների համատեղ շրջանառություն

Վիրուսային հայտնաբերումներ

Հայտնաբերված վիրուսները պատկանում էին 21 վիրուսային ընտանիքների, այդ թվում՝ԱրենավիրիդաևՀանտավիրիդա.

Միջոցովդե նովոMegahit-ի միջոցով հավաքման միջոցով ստեղծվել են 154 վիրուսային կոնտիգ, որոնցից 110-ը համապատասխանում էին ութ ընտանիքների 19 վիրուսների։

In Ապոդեմոս թերակղզի, հայտնաբերվել են հետևյալ վիրուսները՝

Արենավիրուսներ՝ Lassa վիրուս, Wenzhou վիրուս, Gairo վիրուս

l Հանտավիրուսներ՝ Ամուր վիրուս, Պուումալա վիրուս

In Մյոդես ռուֆոկանուսՀայտնաբերվել են առնետի զարկերակիրովիրուս և Ամուրի վիրուս։

Այս պաթոգենների շարքում.

Լասսա վիրուսը վիրուսային հեմոռագիկ տենդի հարուցիչն է, որի մահացության մակարդակը հասնում է մոտ 20%-ի։

Ամուրի վիրուսը երիկամային համախտանիշով հեմոռագիկ տենդի (HFRS) պատճառական գործակալներից մեկն է։ Չինաստանը հայտնում է հանտավիրուսային վարակների ամենաբարձր համաշխարհային բեռի մասին։

Բակտերիալ հայտնաբերումներ

Ընդհանուր առմամբ, մեկնաբանվել է 1051 բակտերիալ սեռ։

Առավել տարածված էին հետևյալ սեռերը.

լՍալմոնելլա(26–31%)

լԵրսինիա(11–23%)

Սալմոնելլասննդային թունավորման հիմնական հարուցիչ է, որը պատասխանատու է ամբողջ աշխարհում տիֆի մոտ 9 միլիոն դեպքի և տարեկան մոտ 110,000 մահվան պատճառ դառնալու համար։

Յերսինիա պեստիսժանտախտի հարուցիչը պատասխանատու է եղել երեք պատմական համավարակների համար։ Հեյլունցզյան նահանգը ճանաչվում է որպես Չինաստանի բնական ժանտախտի օջախներից մեկը և մնում է ժանտախտի հսկողության առաջնահերթ տարածաշրջան։

Ուսումնասիրության նշանակությունը

Գիտական ​​ներդրումներ

Այս ուսումնասիրությունը Հեյլունցզյան նահանգի կրծողների մոտ Լասսայի վիրուսի բեկորների և առնետի զարկերակի վիրուսի հայտնաբերման առաջին զեկույցն է, որը ընդլայնում է Չինաստանի կրծողների միջոցով փոխանցվող հարուցիչների տվյալների բազան։

Այն համակարգված կերպով բնութագրում է տեղական կրծողների պոպուլյացիաների վիրուսային և մանրէային համակեցությունները՝ տրամադրելով սահմանամերձ շրջաններում զոոնոտիկ հիվանդությունների հսկողության համար բազային տվյալներ։

Հանրային առողջության հետևանքները

Արդյունքները ընդգծում են շարունակական հսկողության և պաթոգենների սկրինինգի անհրաժեշտությունըA. peninsulaeևՄ. ռուֆոկանուս.

Տվյալները գիտական ​​​​ապացույցներ են տրամադրում, որոնք հաստատում են ժանտախտի և երիկամային համախտանիշով հեմոռագիկ տենդի նման հիվանդությունների աղբյուրի վերահսկման ռազմավարությունները։

Մեթոդաբանական ուժեղ կողմերը

Մետագենոմիկ հաջորդականացումը հնարավորություն է տալիս անաչառորեն հայտնաբերել ինչպես հայտնի, այնպես էլ նոր պաթոգենները։

Այս ուսումնասիրության մեջ Macro & Micro-Test-ի պաթոգենների հարստացման տեխնոլոգիան ցույց տվեց բարձր արդյունավետություն՝ արդյունավետորեն բարելավելով թիրախային պաթոգենների հայտնաբերումը բարդ կենսաբանական նմուշներում: Արդյունքները հաստատում են դրա կարողությունը՝ ապահովելու բարձր զգայունության պաթոգենների նույնականացումը վայրի բնության հսկողության մեջ:

Արտադրանքի առաջարկ

Այս ուսումնասիրության մեջ իր հաջող կիրառման շնորհիվ, մակրո և միկրո թեստավորման պաթոգեն ՌՆԹ հարստացման հավաքածուն խիստ խորհուրդ է տրվում մետագենոմիկ հսկողության հետազոտությունների համար։

Արդյունավետորեն սպառելով տիրոջ նուկլեինաթթուները և հարստացնելով մանրէային հաջորդականությունները, հավաքածուն զգալիորեն բարելավում է հայտնաբերման զգայունությունը և տվյալների որակը: Այն ներկայացնում է բարդ նմուշներում պաթոգենների ճշգրիտ հայտնաբերման կարևոր գործիք և ապահովում է հանրային առողջապահության հսկողության, զոոնոտիկ ռիսկի գնահատման և բռնկման պատրաստվածության համար հուսալի տեխնիկական աջակցություն:

Contact to learn more: marketing@mmtest.com